Nakon smrti Zorana Đinđića iza njega je ostala neutešna porodica. Sa suprugom Ružicom Đinđić, dobio je dvoje dece čije suze na njegovoj sahrani Srbija i danas pamti.
Ćerka Jovana danas ima 32 godine i radi u Vladi Srbije, dok sin Luka ima 29 godina, a završio je Fakultet političkih nauka.
Jovana je 2013. godine diplomirala Komunikologiju, a zatim je master studije završila u Londonu. Od 2016. stažirala je u Timu za socijalno uključivanje i smanjenje siromaštva, a od juna 2017. godine, Jovana Đinđić je koordinator za rodnu ravnopravnost i ljudska prava.
Za Luku se govorilo da ima političkih afiniteta i da bi se mogao naći u ulozi narodnog poslanika, međutim do toga još uvek nije došlo.
Od ranog detinjstva Jovanin i Lukin život obeležen je političkom karijerom njihovog oca. Luka se još kao trogodišnji dečak proslavio tokom čuvenih demonstracija u zimu 1996. i 1997. godine. Njegova slika na očevim ramenima na čelu demonstranata ispred kojih je bio postavljen transparent “Beograd je svet” - obišla je našu planetu.
Zoran i Ružica venčali su se 1990. godine i postali roditelji Jovane, a onda su 1993. dobili drugo dete, sina Luku.
"Ostali smo zauvek sami, nas troje, a svi ti velevažni prijatelji su se razbežali, i ubuduće su nam prilazili samo kao nejasne senke, u međuvremenu i sami postajući javne medijske pojave. Uz vest o njegovoj smrti i oni su konačno postali neko i nešto. Što su oni bivali sve važniji i važniji, moja tuga i bol su u istoj meri rasli. A ja sam deci morala da objasnim važnost našeg kraja", rekla je Ružica nakon Zoranove smrti.
Inače, u trenuku ubistva premijera Zorana Đinđića, Jovana je imala 13, a Luka 10 godina.